W tym protokole dla ostrych stanów zagrożenia życia, krople MMS1 i kapsułki MMS2 są przyjmowane na przemian przez cały dzień. MMS1 to nasz dobrze znany zestaw MMS z dwutlenkiem chloru jako substancją aktywną. MMS2 opiera się na materiale wyjściowym podchlorynie wapnia, który jest przekształcany w substancję czynną kwas podchlorowy poprzez aktywację go wodą. Podchloryn wapnia jest również zatwierdzony do dezynfekcji wody pitnej i często jest sprzedawany jako środek do czyszczenia basenów. Aplikacje MMS2 zostały już szczegółowo wyjaśnione oddzielnie. Zasadniczo, za pomocą MMS1 uruchamiasz normalny protokół MMS-1000, z wyjątkiem tego, że zamiast brać roztwór dwutlenku chloru za każdym razem, pijesz kapsułkę MMS2 z 2-3 dużymi szklankami wody. Jim Humble proponuje do 4 kapsułek dziennie, każda zawierająca do 400mg podchlorynu wapnia. Powinno być to postrzegane jako absolutna górna granica, dr Antje Oswald zaleca znacznie niższe ilości napełnienia w kapsułkach. MMS2 i ten protokół zostały opracowane dla ciężkich do zagrażających życiu chorób, takich jak rak.