Die einzelne Einnahme von MMS2-Kapseln mehrmals über den Tag wird auch manchmal als Protokoll-4000 bezeichnet. Am besten stellt man die Kapseln mit dem Calciumhypochlorit selber. So kann man die Füllmenge bestimmen und langsam steigern bis zu ca. 400mg pro Kapsel. Dies wird an anderer Stelle ausführlich beschrieben.